Inflamaţie a mucoaselor intestinului subţire şi a colonului cauzată de o bacterie, de un virus sau de un parazit. Contaminarea se face prin ingestia alimentelor infectate sau prin transmisie între indivizi. Simptomele ei sunt o diaree apoasă sau sangvinolentă, crampe abdominale, vărsături, asociate sau nu cu febră.
Enterocolita bacteriană  – cauzată de o bacterie vie care distruge mucoasa (shigelloze, salmonelloze, yersinioze cu Cumpylobacter jejuni) sau de o bacterie care produce o toxină responsabilă de o hipersecreţie hidroelectrolitică (holeră, intoxicaţii alimentare).
Enterocolita virală – cauzată de retrovirusuri, afectează copiii şi evoluează de la sine către vindecare.
Citomegalovirusul care afectează subiecţii imunodeprimaţi şi bolnavii de SIDA poate provoca o afectiune atingere gravă a colonului şi a rectului, cu leziuni de tip ischemic (întreruperea circulaţiei sangvine).
Enterocolita parazitară – parazitozele frecvente sunt amibiaza (afectarea duodenojejunală), bolnavii de SIDA sau persoanele imunodeprimate pot suferii infestări intestinale grave (criptosporidioză sau anguililoză).
Enterocolita inflamatorie – inflamaţie de origine neinfecţioasă a mucoaselor intestinului subţire şi a colo­nului, Boala lui Crohn reprezintă forma principală a acestui tip de enterocolită.