Principalul rol al intestinului subţire este de a absorbi nutrienţii din alimentele pe care le consumi, în celulele sangvine. Sindromul de malabsorbţie se referă la un număr de afecţiuni prin care intestinul subţire nu poate absorbi suficienţi nutrienţi şi fluide. De cele mai multe ori este vorba de macronutrienţi precum proteine, carbohidraţi şi grăsimi, micronutrienţi precum vitamine şi minerale sau amândouă.
Posibile cauze:

deteriorarea intestinului din cauza infecţiei, inflamaţiei sau a unei intervenţii
consumul îndelungat de antibiotice
intoleranţă la lactoză
alte afecţiuni precum boala lui Crohn, pancreatită cronică, fibroză chistică
defecte congenitale sau prezente la naştere
boli de pancreas, ficat sau ale vezicii biliare